Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Phf11bB4XVQ1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Phf11bB4XVQ1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phf11bB4XVQ1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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