Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cyp26c1B2RXA7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms