Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cped1B2RX70 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cped1B2RX70 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms