Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms