Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prrt4B2RU40 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms