Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc22a28B2RT89 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms