Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rrn3B2RS91 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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