Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud4B2RRE7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms