Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brpf1B2RRD7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms