Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf3B2RQG2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms