Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

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Length 589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AU022751B1B0V2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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