Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms