Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf25B1AWN9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf25B1AWN9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms