Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spocd1B1ASB6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms