Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik3B1AS29 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms