Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp36B1AQJ2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms