Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm3173A6NAS3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms