Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6880A3KG45 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms