Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Atp8b5A3FIN4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Atp8b5A3FIN4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Atp8b5A3FIN4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Atp8b5A3FIN4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp8b5A3FIN4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Atp8b5A3FIN4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Atp8b5A3FIN4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Atp8b5A3FIN4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp8b5A3FIN4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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