Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
4931406B18RikA2RSL7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4931406B18RikA2RSL7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms