Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1jA2BFR3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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