Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttll9A2APC3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttll9A2APC3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms