Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1A2ANU3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms