Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FocadA2AKG8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FocadA2AKG8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FocadA2AKG8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms