Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Frmpd1A2AKB4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmpd1A2AKB4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms