Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ckap5A2AGT5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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