Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc163A2AGD7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms