Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prdm16A2A935 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm16A2A935 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms