Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbf1A2A870 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbf1A2A870 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbf1A2A870 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fbf1A2A870 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms