Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Krtap29-1A2A5X4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms