Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YE38

4932443I19Rik, RIKEN cDNA 4932443I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932443I19RikA0A286YE38 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4932443I19RikA0A286YE38 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4932443I19RikA0A286YE38 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms