Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms