Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
A0A0U1RNP2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A0A0U1RNP2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms