Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4921501E09RikA0A0R4J054 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms