Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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