Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Trbv30A0A0B4J1P1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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