Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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