Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trbv21A0A0A6YX06 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trbv21A0A0A6YX06 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Trbv21A0A0A6YX06 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv21A0A0A6YX06 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv21A0A0A6YX06 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv21A0A0A6YX06 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv21A0A0A6YX06 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv21A0A0A6YX06 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv21A0A0A6YX06 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv21A0A0A6YX06 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv21A0A0A6YX06 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Trbv21A0A0A6YX06 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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