Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Trav4-2A0A075B638 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trav4-2A0A075B638 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trav4-2A0A075B638 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trav4-2A0A075B638 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trav4-2A0A075B638 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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