Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B601

Trav9-1, T cell receptor alpha variable 9-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav9-1A0A075B601 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav9-1A0A075B601 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav9-1A0A075B601 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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