Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAM2Q15035 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms