Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TM6SF1Q9BZW5 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TM6SF1Q9BZW5 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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