Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC8.78□□□□□ -1
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NEUROD1Q13562 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC8.78□□□□□ -1
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NEUROD1Q13562 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
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NEUROD1Q13562 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC8.78□□□□□ -1
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NEUROD1Q13562 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.77□□□□□ -1
NEUROD1Q13562 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
NEUROD1Q13562 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
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