Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CHAF1AQ13111 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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