Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CCDC96Q2M329 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms