Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GTF3C6Q969F1 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms