Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17190V9GX38 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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