Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc23a1Q9Z2J0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms