Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms