Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfkbiaQ9Z1E3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms